重庆市水产科学研究所是1984年经重庆市人民政府批准成立的重庆市唯一的市级水产科研机构，全额拨款的公益二类事业单位。2013年经市编办批准加挂了重庆市农垦农产品质量安全检验检测站牌子，实行“两块牌子，一套班子”运行模式。重庆市水产科学研究所（重庆农垦农产品质量安全检验检测站）目前主要有六大职能：一是开展水产科学研究，促进水产事业发展；二是开展水产养殖及病害防治研究；三是开展水产品质量安全研究；四是开展渔业资源调查、研究和评估，承担长江中上游濒危水生动物物种科学研究、保护、开发利用；五是开展水产科研技术推广与交流合作工作；六是开展农产品质量
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